Program Keahlian Akuntansi di SMK Al-Falah Winong Pati bertujuan mencetak lulusan yang kompeten di bidang akuntansi, administrasi keuangan, dan perpajakan sesuai dengan kebutuhan dunia kerja, dunia usaha, dan dunia industri (DUDI). Peserta didik dibekali kemampuan dalam menyusun laporan keuangan, melakukan pembukuan manual maupun komputerisasi, mengelola transaksi keuangan, serta melaksanakan administrasi perkantoran dan perpajakan dengan disiplin, teliti, dan jujur. Melalui pendekatan Project Based Learning (PjBL) dan Praktik Kerja Lapangan (PKL), siswa tidak hanya menguasai teori, tetapi juga terampil dalam penggunaan aplikasi akuntansi modern.